기존 간암 진단법은 낮은 정확도와 특이성 부족으로 조기 진단에 한계가 있었습니다. 특히 지방간이나 간염 환자와의 구분이 어려워 새로운 바이오마커 개발이 절실한 상황이었습니다. 본 발명은 이러한 문제를 해결하기 위해 올레이트 단일불포화 지방산에 의해 증식하는 간암세포에서 발현이 증가하는 18종의 신규 단백질 바이오마커를 발굴하였습니다. 이 마커들은 간암 발병 가능성을 예측하고, 특히 올레이트 관련 증식성 간암을 정확하게 진단하는 데 활용될 수 있습니다. 본 기술은 간암 진단용 조성물, 진단 키트, 그리고 진단 정보 제공 방법에 적용되어 간암의 조기 발견 및 치료 전략 수립에 기여할 것으로 기대됩니다.
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올레이트)이 간암에 미치는 구체적인 영향과 관련 인자에 대한 연구는 미비하여, 이를 규명하고 진단에 활용할 필요가 있습니다.
40~50%)을 보완하여 간암 진단의 정확도를 높일 수 있습니다.본 연구의 목적은 단일불포화 지방산의 일종인 올레이트가 간암세포의 증식을 촉진하는지 확인하고, 이 과정에서 발현 변화를 보이는 새로운 분비 단백질을 발굴하여 간암 조기 진단의 정확성을 높일 수 있는 신규 바이오마커로 제시하는 것입니다.
실험 결과, 지방산의 일종인 올레이트가 간암 세포주(HepG2)의 세포 증식을 유의미하게 촉진하는 것으로 확인되었습니다. 특히, 암세포 증식 억제 활성이 있는 것으로 알려진 팔미테이트와 함께 처리했을 때보다 올레이트 단독 처리 시 세포 증식이 현저히 높게 나타나, 올레이트의 특이적인 증식 촉진 활성을 재확인했습니다. 단백질체 분석을 통해 올레이트 처리에 의해 분비량이 유의하게 변하는 단백질(DSP) 349개를 동정했으며, 이 중 145개는 발현이 증가하고 192개는 감소했습니다. 이 가운데 기존에 간암 관련성이 보고되지 않은 18개의 신규 단백질을 새로운 진단 바이오마커 후보로 최종 발굴했습니다.
올레이트 처리 시 간암세포에서 증가하는 신규단백질 목록
번호 | UniProtKB Accession | Entrez ID | Symbol | Description | log2-fold change |
|---|---|---|---|---|---|
1 | Q96DT5 | 8701 | DNAH11 | dynein, axonemal, heavy chain 11 | 2.865 |
2 | Q9BPW8 | 8508 | NIPSNAP1 | nipsnap homolog 1 | 1.719 |
3 | O15067 | 5198 | PFAS | phosphoribosylformylglycinamidine synthase | 1.696 |
4 | Q6IN85 | 55671 | PPP4R3A | protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A | 1.527 |
5 | Q8NI22 | 90411 | MCFD2 | multiple coagulation factor deficiency 2 | 1.375 |
6 | O43847 | 4898 | NRDC | nardilysin convertase | 1.354 |
7 | Q86V81 | 10189 | ALYREF | Aly/REF export factor | 1.291 |
8 | P51659 | 3295 | HSD17B4 | hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4 | 1.265 |
9 | Q14651 | 5357 | PLS1 | plastin 1 | 1.212 |
10 | P20142 | 5225 | PGC | progastricsin (pepsinogen C) | 1.165 |
11 | Q9H993 | 79624 | ARMT1 | acidic residue methyltransferase 1 | 1.099 |
12 | Q9UHG2 | 27344 | PCSK1N | proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor | 1.070 |
13 | Q9NYU2 | 56886 | UGGT1 | UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 | 1.034 |
14 | O95433 | 10598 | AHSA1 | AHA1, activator of heat shock 90kDa protein ATPase homolog 1 (yeast) | 1.031 |
15 | P02795 | 4502 | MT2A | metallothionein 2A | 1.029 |
16 | Q14696 | 23184 | MESDC2 | mesoderm development candidate 2 | 1.016 |
17 | P06865 | 3073 | HEXA | hexosaminidase subunit alpha | 1.014 |
18 | P19823 | 3698 | ITIH2 | inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 2 | 1.002 |
간암을 포함한 간 질환 진단 시장과 체외진단 시장은 인구 고령화, 만성 질환 증가, 조기 진단 패러다임 확산에 따라 꾸준히 성장하고 있습니다. 특히 분자진단 기술의 발전은 암 진단 시장의 성장을 가속화하고 있습니다.
간암 진단 시장은 기존의 AFP, PIVKA-II와 같은 혈청 바이오마커가 주를 이루고 있으나, 낮은 민감도와 특이도로 인해 새로운 기술에 대한 요구가 높습니다. 본 발명에서 제시하는 신규 바이오마커는 이러한 기존 마커의 한계를 보완하며 시장에 새로운 경쟁 구도를 형성할 잠재력을 가집니다.
구분 | 바이오마커 종류 | 특징 및 한계점 |
|---|---|---|
기존 바이오마커 | 알파태아단백(AFP) | 가장 대표적인 간암 종양 마커이지만 진단율이 40~50%로 낮고, 지방간이나 간염 환자와의 구분이 어려움. |
신규 바이오마커 | 올레이트 유도 18종 단백질 | 단일불포화 지방산에 의해 증식하는 간암 세포에서 특이적으로 발현이 증가하여 기존 마커의 낮은 진단율을 보완하고 조기 진단 가능성을 높임. |